Cette page contient des extraits de code bash. Il faut toujours comprendre ce que le code proposé fait avant de l’exécuter, d’autant plus plus lorsque ce code nécessite les privilèges d’administration (sudo).
Ajouter le CRAN à la liste des dépôts de apt
On commence par ajouter l’adresse de CRAN à la liste des dépôts de apt :
sudo echo "deb http://cloud.r-project.org/bin/linux/debian bookworm-cran40/" > /etc/apt/sources.list.d/cran.listLe script permet d’ajouter l’adresse dans un nouveau fichier, cran.list, que l’on place dans le répertoire /etc/apt/sources.list.d/. Ce répertoire contient des fichiers de listes de dépôts, cela permet de ne pas modifier le fichier /etc/apt/sources.list.
Sécuriser les échanges entre apt et le dépôt CRAN
Après avoir ajouté l’adresse du dépôt, il faut désormais récupérer la clé GPG publique du dépôt afin de sécuriser les échange avec celui-ci.
On télécharge la clé :
gpg --keyserver keyserver.ubuntu.com \
--recv-key '95C0FAF38DB3CCAD0C080A7BDC78B2DDEABC47B7'La clé est stockée sur un serveur de stockage de clés publiques (keyserver.ubuntu.com) et son empreinte (i.e. son identifiant unique) est 95C0FAF38DB3CCAD0C080A7BDC78B2DDEABC47B7. Il serait aussi possible de trouver cette clé en se rendant directement sur le site keyserver.ubuntu.com.
Une fois la clé téléchargée, on la stocke dans le répertoire dédié de apt :
gpg --armor --export '95C0FAF38DB3CCAD0C080A7BDC78B2DDEABC47B7' | \
sudo tee /etc/apt/trusted.gpg.d/cran_debian_key.ascLa clé est convertie en un format ASCII. Elle est ensuite stockée dans le fichier cran_debian_key.asc dans le répertoire /etc/apt/trusted.gpg.d/ qui contient les clés que le gestionnaire de paquets apt a besoin pour sécuriser la communication avec les dépôts.
Une clé GPG (GNU Privacy Guard) est un système de signature cryptographique permettant la communication sécurisée entre deux ordinateurs.
Installer R
Maintenant que le dépôt et sa clé sont configurés, on peut mettre à jour la liste des dépôts :
sudo apt updateSi tout se passe bien on devrait voir passer une ligne avec l’adresse du dépôt CRAN ajouté plus haut.
Enfin, on peut installer R à partir du nouveau dépôt :
sudo apt install r-base r-base-devOn peut vérifier la version de R installée :
R --versionLes étapes décrites ci-dessus sont tirées de la page Debian de CRAN.
Comment avoir une version de R à jour sur Debian ?
Sur Debian, il est possible d’installer
Rà partir du gestionnaire de paquetsapt. Toutefois, la version deRsur les dépôts Debian est généralement moins à jour que la version disponible sur le CRAN. Pour installer la dernière version deRsur Debian il est possible d’ajouter le CRAN à la liste des dépôts gérés parapt.CRAN (Comprehensive R Archive Network)